46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2051 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  79.51 
 
 		 122 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  46.21 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  41.67 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  38.28 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  30.63 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  33.06 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  35 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  37.36 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  37.36 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  37.36 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  38.36 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  28.57 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  30.71 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  32.89 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  31.31 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  36.67 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  33.82 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  35.48 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  41.82 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  35.58 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  35.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  37.65 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  28.08 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  35.59 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  36.67 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  36.11 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  30 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  26.52 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  27.59 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  40.91 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  38.6 
 
 		 148 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  34.31 
 
 		 145 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  24.14 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  39.76 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  39.29 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  33.33 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  34.85 
 
 		 153 aa  40  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  40.38 
 
 		 180 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>