35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2028 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2028  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 56 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  76.6 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  80.85 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  61.7 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  80.85 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.21 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.1 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.54 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  48.21 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.17 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.81 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  48.21 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.16 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.16 
 
 		 249 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  55.26 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.37 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.89 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.68 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.65 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.74 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.83 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.83 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.05 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.37 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.3 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.3 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.48 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.48 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.82 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.82 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.22 
 
 		 246 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>