More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1989 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  79.85 
 
 		 429 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  94.74 
 
 		 437 aa  821    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  75 
 
 		 430 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  94.74 
 
 		 437 aa  839    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  875    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  65.65 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  64.94 
 
 		 424 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  69.42 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  64.18 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  67.75 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  68 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  62.14 
 
 		 437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  60.49 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  61.9 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  62.41 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  62.84 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  59.05 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  55.05 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  55.16 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  54.09 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  52.52 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  51.62 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  52.76 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  53.75 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  57.38 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  51.75 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  50.98 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  51.34 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 430 aa  325  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 429 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  39.76 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.27 
 
 		 430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 412 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 382 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.42 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.99 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  27.88 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.27 
 
 		 402 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 402 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0505965  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.58 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.7 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.2 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.19 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.7 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.7 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.93 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.41 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.47 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.41 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  26.35 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 421 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>