38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1984 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  100 
 
 		 509 aa  1038    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  62.59 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  54.23 
 
 		 695 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  40.7 
 
 		 835 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  44.13 
 
 		 744 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  38.48 
 
 		 739 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  38.96 
 
 		 736 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  38.95 
 
 		 896 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  35.48 
 
 		 789 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  32.94 
 
 		 815 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  32.94 
 
 		 815 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  34.67 
 
 		 818 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  39.13 
 
 		 892 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  31.48 
 
 		 489 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  33.62 
 
 		 781 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  36.39 
 
 		 788 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  36.39 
 
 		 788 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  32.27 
 
 		 789 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  32.79 
 
 		 806 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  29.69 
 
 		 761 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  38.1 
 
 		 736 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  32.76 
 
 		 697 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  29.25 
 
 		 812 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  33.02 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  35.71 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  28.32 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  31.67 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  26.77 
 
 		 725 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  28.05 
 
 		 778 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  48.72 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  50 
 
 		 970 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  48.68 
 
 		 970 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  28.41 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  52.38 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  27.84 
 
 		 749 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  31.97 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  36.49 
 
 		 749 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0934  hypothetical protein  35.48 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>