38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1974 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  32.75 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  38.4 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  31.71 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  40.2 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  38.24 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  38.74 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  37.96 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  38.68 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  27.78 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  41.12 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  39.39 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  38.24 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  33.05 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  40.19 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  29.65 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  41.28 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  31.58 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  30.71 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  35.96 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  30.77 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  29.58 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  27.74 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  39.19 
 
 		 165 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  36.36 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  28.43 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  28.43 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  38.03 
 
 		 72 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  32.26 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  26.81 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  33.03 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  31.45 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  29.01 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  29.57 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  26.24 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  29.7 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  23.05 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>