More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1911 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1911  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
278 aa  563  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00546363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0350  50S ribosomal protein L2  97.48 
 
 
278 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2126  50S ribosomal protein L2  88.49 
 
 
278 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2165  50S ribosomal protein L2  88.13 
 
 
278 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2443  50S ribosomal protein L2  88.13 
 
 
278 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2221  50S ribosomal protein L2  87.77 
 
 
278 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  78.06 
 
 
279 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1357  50S ribosomal protein L2  78.06 
 
 
279 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.184496  normal  0.0354969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1682  50S ribosomal protein L2  80.22 
 
 
277 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463749  hitchhiker  0.0000149038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  78.42 
 
 
278 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  77.7 
 
 
277 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3664  50S ribosomal protein L2  77.7 
 
 
278 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2298  50S ribosomal protein L2  77.34 
 
 
278 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3445  50S ribosomal protein L2  76.26 
 
 
277 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  77.06 
 
 
277 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1367  50S ribosomal protein L2  76.51 
 
 
277 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.266089  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  75.9 
 
 
277 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  76.98 
 
 
277 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  75.54 
 
 
277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1335  50S ribosomal protein L2  74.91 
 
 
278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0836019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  75.9 
 
 
278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  74.55 
 
 
278 aa  400  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1433  50S ribosomal protein L2  74.55 
 
 
278 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  0.0219433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  73.02 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1843  50S ribosomal protein L2  74.91 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0328595  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  73.74 
 
 
277 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626221  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  73.74 
 
 
277 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  71.22 
 
 
279 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  72.89 
 
 
276 aa  384  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  72.53 
 
 
277 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  67.99 
 
 
278 aa  363  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  69.06 
 
 
279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2815  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 
278 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1252  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 
278 aa  355  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 
280 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1350  50S ribosomal protein L2  67.63 
 
 
278 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1617  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 
279 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  67.74 
 
 
280 aa  352  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  67.74 
 
 
280 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 
279 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 
279 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 
279 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 
277 aa  321  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
273 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
273 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0412  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 
276 aa  310  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
273 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
273 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
273 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
273 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
273 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
273 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0678  50S ribosomal protein L2  62.36 
 
 
274 aa  308  5e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.173189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
273 aa  308  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0609  50S ribosomal protein L2  61.85 
 
 
276 aa  308  5e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  308  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  308  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  308  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
273 aa  308  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0298  50S ribosomal protein L2  61.4 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00025292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 
276 aa  301  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  54.74 
 
 
275 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0870  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
274 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0234  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0202  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000118322  unclonable  0.0000000000286265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0197  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0317166  decreased coverage  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0202  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  299  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000998768  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0216  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  298  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000116204  unclonable  0.00000865154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5076  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
274 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000626966  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  58.52 
 
 
273 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4053  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
274 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000480154  unclonable  0.0000000000078999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0199  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
274 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000102621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0203  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
274 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000173146  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4167  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
274 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4545  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
274 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0677044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3756  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
274 aa  298  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0187  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
275 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000586995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0629  ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000177607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  54.64 
 
 
280 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0326  ribosomal protein L2  60.81 
 
 
274 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000480771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3906  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
274 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 
273 aa  297  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3521  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
275 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000287143  hitchhiker  0.00000119311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  54.48 
 
 
279 aa  296  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0161  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
275 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128131  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0487  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0341387  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0173  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 
274 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>