More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1895 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1895  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00848778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0366  50S ribosomal protein L11  96.64 
 
 		 149 aa  293  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.556831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4367  50S ribosomal protein L11  93.24 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3998  50S ribosomal protein L11  93.24 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.748509  normal  0.915544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4479  50S ribosomal protein L11  93.24 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3844  50S ribosomal protein L11  90.54 
 
 		 149 aa  278  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  80.54 
 
 		 149 aa  250  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  81.88 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1343  50S ribosomal protein L11  76.35 
 
 		 142 aa  227  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0774434  normal  0.0441915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  73.15 
 
 		 142 aa  223  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  72.48 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  72.48 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  72.48 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  72.11 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  71.81 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1418  50S ribosomal protein L11  69.8 
 
 		 143 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.816838  normal  0.409457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  69.8 
 
 		 143 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1819  50S ribosomal protein L11  67.79 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.674274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  67.79 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  69.13 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  68.46 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  70.75 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  67.79 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  67.79 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  65.77 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  64.63 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  65.54 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0743  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 150 aa  189  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  63.95 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  61.49 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2956  50S ribosomal protein L11  63.27 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  63.76 
 
 		 148 aa  186  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  62.16 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0563  50S ribosomal protein L11  60.26 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  64.43 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  64.43 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  62.42 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4435  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  63.76 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  63.76 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  64.63 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  64.63 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  63.09 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  63.27 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  62.42 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  62.42 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1703  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 150 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  60.4 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0335  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 150 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0349  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 150 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2546  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  62.42 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  60.4 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  60.4 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  61.9 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  61.74 
 
 		 143 aa  175  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  59.73 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  62.42 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  60.4 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4287  50S ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848232  hitchhiker  0.000000453889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  59.06 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  60.4 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  60.4 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  61.74 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  59.73 
 
 		 143 aa  172  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>