174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1824 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5503  glucan biosynthesis protein D  83.1 
 
 
562 aa  898    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545727  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1824  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
547 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3961  glucan biosynthesis protein D  53.08 
 
 
552 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  49.21 
 
 
536 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3674  glucan biosynthesis protein G  51.86 
 
 
556 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3969  glucan biosynthesis protein G  51.86 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  49.5 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2986  glucan biosynthesis protein D  49.27 
 
 
522 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510691  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.35 
 
 
495 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  42.35 
 
 
503 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  40.82 
 
 
503 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40.35 
 
 
544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.76 
 
 
545 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.76 
 
 
545 aa  362  8e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.37 
 
 
498 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  39.57 
 
 
542 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.57 
 
 
545 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  39.57 
 
 
542 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.57 
 
 
542 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.57 
 
 
542 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  39.11 
 
 
519 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  39.57 
 
 
545 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  37.59 
 
 
540 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  39.8 
 
 
559 aa  349  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  39.12 
 
 
508 aa  339  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  38.6 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  39.7 
 
 
534 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 
498 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  34.83 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  34.01 
 
 
608 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  34.01 
 
 
562 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  34.01 
 
 
562 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  34.01 
 
 
562 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  33.03 
 
 
594 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  34.35 
 
 
568 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  36.87 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  36.14 
 
 
532 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  36.14 
 
 
532 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  33.39 
 
 
597 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  33.39 
 
 
604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  33.39 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  33.93 
 
 
604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  36.27 
 
 
534 aa  300  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  36 
 
 
534 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  34.45 
 
 
546 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  35.47 
 
 
530 aa  297  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  37.78 
 
 
507 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  31.98 
 
 
530 aa  296  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  36.36 
 
 
537 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  36.55 
 
 
534 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  34.52 
 
 
527 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  36.66 
 
 
560 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  34.39 
 
 
529 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  34.39 
 
 
529 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  34.32 
 
 
531 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  34.3 
 
 
529 aa  289  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  35.67 
 
 
533 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  34.66 
 
 
588 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
526 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  36.04 
 
 
528 aa  286  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3563  glucan biosynthesis protein G  38.22 
 
 
513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  33.99 
 
 
527 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  33.99 
 
 
527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  34.26 
 
 
528 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  33.88 
 
 
536 aa  283  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
517 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
511 aa  282  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
517 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
511 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
511 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
511 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  34.58 
 
 
533 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  34.38 
 
 
511 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  34.38 
 
 
517 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  34.38 
 
 
511 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  35.4 
 
 
519 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  35.57 
 
 
534 aa  280  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  32.84 
 
 
517 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  34.47 
 
 
525 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  35.16 
 
 
505 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  34.47 
 
 
525 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  32.84 
 
 
517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  32.84 
 
 
517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  35.02 
 
 
545 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  32.84 
 
 
517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  32.84 
 
 
517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  37.56 
 
 
559 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  37.32 
 
 
579 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  36.62 
 
 
642 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  36.15 
 
 
579 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  34.77 
 
 
539 aa  277  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  36.47 
 
 
560 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  35.79 
 
 
532 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  37.32 
 
 
559 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  33.73 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  34.77 
 
 
539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  34.24 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  36.72 
 
 
604 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  36 
 
 
641 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  36.27 
 
 
517 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>