253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1776 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
240 aa  470  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  74.5 
 
 
257 aa  321  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  72.6 
 
 
218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  74.02 
 
 
216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  73.53 
 
 
216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  73.3 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  64.4 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  59.24 
 
 
239 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  58.54 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  58.91 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  60.33 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  58.45 
 
 
210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  61.88 
 
 
202 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  59.56 
 
 
204 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  59.78 
 
 
241 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  64.09 
 
 
204 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  57.84 
 
 
214 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  56.73 
 
 
214 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  62.16 
 
 
251 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  54.88 
 
 
248 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  60.99 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  60.1 
 
 
201 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  55.29 
 
 
226 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  60.7 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  56.08 
 
 
255 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  57.46 
 
 
198 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  55.31 
 
 
240 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  54.6 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  48.56 
 
 
216 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  46.91 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  53.18 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  53.26 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  48.55 
 
 
223 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  48.55 
 
 
223 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  44.39 
 
 
208 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  46.77 
 
 
210 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  47.73 
 
 
266 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  43.9 
 
 
208 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  42.93 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  48.54 
 
 
252 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  45 
 
 
270 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.37 
 
 
270 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.97 
 
 
228 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  46.53 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.91 
 
 
225 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.78 
 
 
227 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.51 
 
 
237 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  39.56 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  39.44 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  41.14 
 
 
195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  44.16 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  41.99 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  42.13 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  37.68 
 
 
212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  38.8 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  37.5 
 
 
213 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  42.55 
 
 
213 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.48 
 
 
205 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  41.21 
 
 
249 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  39.18 
 
 
208 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.48 
 
 
202 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  38.12 
 
 
208 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  40.94 
 
 
237 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  37.7 
 
 
200 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  38.67 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  38.67 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  39.43 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  37.86 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  37.71 
 
 
205 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  35.16 
 
 
219 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  39.39 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  34.92 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  37.57 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  38.1 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  34.12 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  38.12 
 
 
224 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.12 
 
 
184 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  35.2 
 
 
201 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  36.84 
 
 
201 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  35.68 
 
 
201 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  35.26 
 
 
188 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  35.98 
 
 
208 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  35.9 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  39.81 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  34.45 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  33.33 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  42.11 
 
 
228 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  36 
 
 
226 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  36.32 
 
 
201 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  37.14 
 
 
201 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  36.84 
 
 
199 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  31.84 
 
 
209 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  34.25 
 
 
214 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  34.83 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  35.91 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  39.27 
 
 
200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  35.79 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  34.17 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  36.32 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  35.71 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>