180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1727 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 333 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  87.31 
 
 		 333 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  71.9 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  71.15 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  71.9 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  66.14 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  51.26 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  45.89 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  49.69 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  49.21 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  49.52 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  48.72 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  48.08 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  50.66 
 
 		 345 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  46.47 
 
 		 315 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  48.25 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  44.13 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  41.95 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  41.72 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  38.86 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  39.76 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  37.03 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  39.14 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  38.08 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  32.34 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  33.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  33.22 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  33.55 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  34.38 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  31.47 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  32.12 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  28.74 
 
 		 638 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  29.72 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  30.83 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  32.45 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  32.46 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  32.45 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  33.21 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  31.23 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  31.23 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  33.58 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  31.23 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  31.23 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  31.23 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  31.23 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  31.32 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  34.44 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  34.44 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  31.89 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  30.43 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  26.18 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  29.89 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  24.81 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  24.82 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  30.67 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.3 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>