299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1710 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  100 
 
 
295 aa  577  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  91.1 
 
 
292 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  67.24 
 
 
296 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  66.89 
 
 
296 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  66.21 
 
 
297 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  65.87 
 
 
297 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  62.85 
 
 
311 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  59.73 
 
 
298 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  59.03 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  56.21 
 
 
289 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  54.58 
 
 
292 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  53.22 
 
 
297 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  53.22 
 
 
297 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  53.55 
 
 
298 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  61.22 
 
 
299 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  56.49 
 
 
312 aa  275  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  56.79 
 
 
320 aa  275  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  54.85 
 
 
304 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  52.08 
 
 
294 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  51.74 
 
 
294 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  58.78 
 
 
281 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  57.89 
 
 
277 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  56.84 
 
 
274 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  50.56 
 
 
299 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  53.68 
 
 
289 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  46.74 
 
 
296 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  57.49 
 
 
277 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  48.52 
 
 
305 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  48.63 
 
 
289 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  55.38 
 
 
293 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  46.9 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  52.07 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  48.56 
 
 
308 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  59.18 
 
 
270 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  58.67 
 
 
270 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  49.65 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  49.23 
 
 
274 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  48.74 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
376 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  41.2 
 
 
305 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  43.72 
 
 
330 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  44.69 
 
 
257 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  42.25 
 
 
354 aa  143  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  35.81 
 
 
348 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  41.22 
 
 
260 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  38.01 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  35.84 
 
 
263 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  36.47 
 
 
263 aa  120  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  36.63 
 
 
291 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.91 
 
 
295 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  33.9 
 
 
290 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  30.18 
 
 
295 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  32.27 
 
 
291 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  33.94 
 
 
240 aa  105  6e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.69 
 
 
294 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  40 
 
 
295 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.16 
 
 
309 aa  99  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  34.46 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.15 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.15 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.9 
 
 
294 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  30.08 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  29.15 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  31.03 
 
 
281 aa  89.4  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  30.6 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.95 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  35.75 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  32.24 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  38.92 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.7 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  31.87 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.7 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  35.56 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  35.56 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  35.56 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  35.56 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  35.56 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  35.56 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  26.72 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  34.64 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  32.29 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  32.29 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  32.95 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  38.96 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  29.89 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  26.26 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  32.54 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>