More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1691 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  83.49 
 
 
935 aa  1491    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  60.11 
 
 
927 aa  1018    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  61.46 
 
 
888 aa  1044    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  58.84 
 
 
937 aa  1035    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  52.35 
 
 
942 aa  877    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  59.61 
 
 
927 aa  1017    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  58.86 
 
 
934 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  58.12 
 
 
934 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  59.04 
 
 
922 aa  1035    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  58.32 
 
 
937 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  59.96 
 
 
925 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  58.77 
 
 
911 aa  1025    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  70.36 
 
 
921 aa  1216    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  47.77 
 
 
928 aa  749    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  69.44 
 
 
921 aa  1234    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  70.17 
 
 
916 aa  1229    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
878 aa  1737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  42.3 
 
 
910 aa  659    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  70.61 
 
 
916 aa  1235    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  41.79 
 
 
766 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
760 aa  512  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
796 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.02 
 
 
801 aa  488  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
728 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
1063 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  48.22 
 
 
742 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 
792 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  40.71 
 
 
769 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 
822 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  40.58 
 
 
769 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.94 
 
 
819 aa  429  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  40.1 
 
 
769 aa  422  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  39.81 
 
 
770 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  39.53 
 
 
785 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.97 
 
 
1104 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  40.13 
 
 
770 aa  411  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.6 
 
 
783 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  46.68 
 
 
870 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.63 
 
 
774 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
812 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 
803 aa  387  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
770 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
607 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.07 
 
 
610 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
598 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  33.5 
 
 
807 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.39 
 
 
601 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
603 aa  366  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
604 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
650 aa  364  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
871 aa  344  5e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
1031 aa  334  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
606 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
687 aa  331  3e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.26 
 
 
639 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
666 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
681 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.84 
 
 
669 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.83 
 
 
1089 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.63 
 
 
806 aa  320  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  34.54 
 
 
625 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
745 aa  318  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.32 
 
 
767 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
673 aa  317  6e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.45 
 
 
662 aa  316  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
919 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
713 aa  313  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
653 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  39 
 
 
677 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
660 aa  313  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
919 aa  312  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
688 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  41.55 
 
 
744 aa  310  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 
691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
655 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.92 
 
 
754 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
920 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
694 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.75 
 
 
734 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  42.56 
 
 
785 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  41.2 
 
 
744 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
957 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  42.68 
 
 
754 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
674 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
954 aa  307  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
719 aa  307  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
737 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.44 
 
 
927 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  43.65 
 
 
748 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  43.65 
 
 
758 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  43.64 
 
 
748 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  41.29 
 
 
736 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  43.92 
 
 
753 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  41.97 
 
 
714 aa  303  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.42 
 
 
654 aa  304  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
1030 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
695 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>