More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1623 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  83.9 
 
 
441 aa  703    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  83.45 
 
 
441 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  81.41 
 
 
441 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  83.22 
 
 
441 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  100 
 
 
441 aa  863    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  94.56 
 
 
441 aa  823    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  58.37 
 
 
438 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  58.72 
 
 
442 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  59.45 
 
 
448 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  58.53 
 
 
442 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  56.49 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 
448 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 
442 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 
438 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  58.9 
 
 
447 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  53.94 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  52.97 
 
 
442 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  53.2 
 
 
442 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  58.1 
 
 
447 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  54.3 
 
 
440 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  54.61 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  56.65 
 
 
447 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  51.92 
 
 
470 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  53 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  54.15 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  52.86 
 
 
423 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  54.21 
 
 
422 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  51.68 
 
 
444 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  53.88 
 
 
424 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  54.55 
 
 
412 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  53.78 
 
 
424 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  53.02 
 
 
435 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  56.32 
 
 
422 aa  355  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  43.02 
 
 
440 aa  353  4e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 
437 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  47.07 
 
 
467 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  51.38 
 
 
437 aa  319  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  48.28 
 
 
397 aa  319  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  44.39 
 
 
453 aa  300  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  39 
 
 
429 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  40.05 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  43.69 
 
 
443 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  39.57 
 
 
435 aa  279  8e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  41.08 
 
 
435 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  38.77 
 
 
442 aa  250  4e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  41 
 
 
426 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.06 
 
 
427 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.78 
 
 
412 aa  209  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
425 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.38 
 
 
422 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 
424 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  35.62 
 
 
426 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 
424 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.72 
 
 
457 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.16 
 
 
418 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.92 
 
 
418 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.21 
 
 
431 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  39.57 
 
 
440 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.06 
 
 
459 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.45 
 
 
428 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.05 
 
 
424 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
437 aa  190  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
429 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
420 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
432 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.85 
 
 
427 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  39.49 
 
 
403 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  38.04 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  32.79 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.8 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
447 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.72 
 
 
442 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
424 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  35.61 
 
 
425 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.63 
 
 
424 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.06 
 
 
422 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  40.49 
 
 
448 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.32 
 
 
441 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.28 
 
 
434 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  33.42 
 
 
421 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  35.03 
 
 
436 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.04 
 
 
429 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.64 
 
 
441 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
435 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.29 
 
 
438 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
437 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  36.56 
 
 
436 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  39.26 
 
 
437 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  40 
 
 
386 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
435 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.83 
 
 
420 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  35.68 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 
425 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  33.72 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 
431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.43 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  36.14 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>