More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1605 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  50.78 
 
 		 903 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  48.46 
 
 		 838 aa  728    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.46 
 
 		 842 aa  1049    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  68.03 
 
 		 846 aa  1049    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.94 
 
 		 857 aa  1057    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 837 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  48.56 
 
 		 835 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 843 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 		 837 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 		 837 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 838 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.68 
 
 		 859 aa  800    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 		 843 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 830 aa  1639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  90.36 
 
 		 830 aa  1440    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.69 
 
 		 862 aa  1068    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  44.79 
 
 		 858 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  43.55 
 
 		 837 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  43.55 
 
 		 859 aa  608  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 		 861 aa  607  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  43.15 
 
 		 826 aa  602  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 861 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 861 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  40.36 
 
 		 911 aa  595  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  52.7 
 
 		 837 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  36.97 
 
 		 824 aa  498  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 829 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 770 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 782 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 798 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 787 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 582 aa  171  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 1352 aa  171  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  40.42 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 442 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 442 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 646 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 763 aa  163  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 562 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 523 aa  162  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  38.43 
 
 		 774 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 774 aa  159  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 975 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1603 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 1274 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 617 aa  157  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 844 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 784 aa  156  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 484 aa  156  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 773 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.66 
 
 		 771 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  35.04 
 
 		 603 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 775 aa  155  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 911 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 779 aa  154  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  35.11 
 
 		 617 aa  154  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 389 aa  154  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 778 aa  154  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 687 aa  154  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 970 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  36.61 
 
 		 771 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 851 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  33.2 
 
 		 828 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1046 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 974 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3802  histidine kinase  34.46 
 
 		 1121 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 875 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1350 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 587 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  34.26 
 
 		 908 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 754 aa  151  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  27.78 
 
 		 773 aa  151  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 769 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 661 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  28.89 
 
 		 783 aa  150  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 770 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  28.89 
 
 		 783 aa  150  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.68 
 
 		 762 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 		 1126 aa  150  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 600 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 833 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 1029 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 884 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1070 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  37.21 
 
 		 461 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  33.1 
 
 		 576 aa  148  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 		 1369 aa  148  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1143 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1021  histidine kinase  30.96 
 
 		 1109 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 383 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 885 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  36.76 
 
 		 729 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 605 aa  146  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1118 aa  147  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 772 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1267 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>