218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1583 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
210 aa  430  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  79.9 
 
 
207 aa  339  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  48.02 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  47 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  47.96 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  43.41 
 
 
221 aa  164  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  45.92 
 
 
222 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  41.75 
 
 
233 aa  160  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 
221 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 
216 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  41.06 
 
 
224 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 
214 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
213 aa  151  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  40.39 
 
 
222 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  41.87 
 
 
214 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  42.36 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  43.43 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  40.19 
 
 
224 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  40.19 
 
 
224 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  38.65 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 
221 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
209 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  39.42 
 
 
214 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 
221 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  40.98 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  38.65 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 
217 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 
220 aa  138  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 
208 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
215 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  39 
 
 
221 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  39.49 
 
 
221 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
234 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  36.23 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  36.23 
 
 
243 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 
216 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
235 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 
217 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
217 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  32.68 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  35.61 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
237 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  36.23 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  36.71 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 
230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 
222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  35.75 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  35.75 
 
 
243 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  31.73 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  41.21 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 
244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  35.81 
 
 
230 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  36.23 
 
 
223 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  37.81 
 
 
256 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  39.07 
 
 
224 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  42.23 
 
 
222 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5763  DSBA oxidoreductase  37.88 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
213 aa  121  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 
222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.5 
 
 
219 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  35.92 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  35.18 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
237 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 
221 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  35.61 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  33.01 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.5 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10641  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  33.02 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  33.33 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 
239 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 
240 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>