More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1560 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  78.98 
 
 		 176 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  63.19 
 
 		 181 aa  220  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  47.34 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 232 aa  158  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  48.45 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  48.75 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  48.45 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  47.89 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  46.15 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  47.26 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  50.36 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  47.92 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  50.38 
 
 		 139 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  45.71 
 
 		 169 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  44.31 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  41.72 
 
 		 170 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  44.52 
 
 		 174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  44.97 
 
 		 191 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  42.04 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  39.77 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  48.92 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  43.8 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  40.56 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  46.43 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  45.71 
 
 		 158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 144 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 144 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 144 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  41.73 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  37.23 
 
 		 142 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  45.26 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  52.69 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  37.23 
 
 		 147 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  39.42 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  43.8 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  43.07 
 
 		 145 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  43.07 
 
 		 145 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 144 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 144 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  45.26 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  45.26 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  45.26 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  45.26 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  45.26 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  44.85 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  44.53 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 		 148 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  44.21 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  37.69 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  39.84 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  37.9 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  28.79 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  35.4 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  32.46 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  32.46 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  35.4 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  32.46 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  35.4 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>