215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1559 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  84.38 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 171 aa  208  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  66.67 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  71.25 
 
 		 160 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  74.62 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  59.26 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  67.68 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  66.67 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 145 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 133 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  61.96 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  70 
 
 		 145 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  66.41 
 
 		 144 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 142 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  58.97 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  66.67 
 
 		 133 aa  174  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  62.42 
 
 		 160 aa  173  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  58.93 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  57.93 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  60 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  68.6 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  63.5 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 143 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  57.14 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  59.09 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  67.48 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  66.41 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 143 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  54.55 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  64.34 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  67.77 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  59.48 
 
 		 174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  67.97 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  62.12 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  64.86 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  66.12 
 
 		 135 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  59.26 
 
 		 189 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 170 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  61.19 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 140 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  71.19 
 
 		 133 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5176  MucR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  54.19 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  53.01 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  53.96 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  56.82 
 
 		 147 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  63.64 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  53.99 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 166 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 185 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  63.41 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  55.12 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  55.12 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  53.33 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  55.91 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  53.49 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  55.47 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  55.47 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  56.2 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  49.37 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  50.33 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  49.67 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1275  transcriptional regulator, MucR family  52.94 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  49.67 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  55.12 
 
 		 138 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 139 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  56.35 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  47.5 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  55.12 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  54.84 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>