More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1549 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  100 
 
 
413 aa  819  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  69.29 
 
 
414 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  58.27 
 
 
411 aa  459  1e-128  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  58.05 
 
 
411 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  55.93 
 
 
411 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  52.06 
 
 
416 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  50.73 
 
 
411 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  54.15 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  53.52 
 
 
420 aa  400  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  52.84 
 
 
413 aa  398  1e-110  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  53.61 
 
 
413 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  53.49 
 
 
413 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  53.87 
 
 
412 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  51.95 
 
 
419 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  51.22 
 
 
419 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  49.64 
 
 
415 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  54.99 
 
 
405 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  52.25 
 
 
461 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  52.32 
 
 
403 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  51.77 
 
 
425 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  46.38 
 
 
408 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  47.92 
 
 
405 aa  329  5e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  44.71 
 
 
413 aa  321  1e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  47.03 
 
 
418 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  47.07 
 
 
391 aa  318  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  46.57 
 
 
417 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  46.84 
 
 
425 aa  308  2e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  44.28 
 
 
407 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  41.79 
 
 
443 aa  292  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  45.07 
 
 
409 aa  285  1e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  39.95 
 
 
412 aa  284  2e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.35 
 
 
406 aa  282  6e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  39.08 
 
 
412 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  37.88 
 
 
445 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  39.12 
 
 
428 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  34.2 
 
 
436 aa  240  3e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  40.71 
 
 
393 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  34.43 
 
 
433 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  35.61 
 
 
440 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.94 
 
 
451 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.03 
 
 
420 aa  214  2e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  36.08 
 
 
426 aa  214  3e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  35.7 
 
 
461 aa  213  4e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.57 
 
 
445 aa  213  4e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.91 
 
 
456 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  35.31 
 
 
429 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.55 
 
 
486 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  35.37 
 
 
447 aa  209  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  33.95 
 
 
419 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  34.81 
 
 
478 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  34.03 
 
 
434 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  36.39 
 
 
438 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  34.97 
 
 
490 aa  198  1e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.29 
 
 
426 aa  197  4e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.97 
 
 
445 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  34.68 
 
 
482 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  36.79 
 
 
440 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.43 
 
 
407 aa  189  6e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.6 
 
 
407 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.2 
 
 
426 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  32.56 
 
 
447 aa  185  1e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.21 
 
 
413 aa  185  1e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.73 
 
 
447 aa  181  3e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  36.46 
 
 
433 aa  180  5e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  36.36 
 
 
470 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.07 
 
 
421 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  31.74 
 
 
430 aa  174  2e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  32.4 
 
 
396 aa  174  4e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  28.77 
 
 
444 aa  173  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.17 
 
 
444 aa  172  8e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.87 
 
 
433 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  28.76 
 
 
459 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  33.51 
 
 
431 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.86 
 
 
430 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.88 
 
 
459 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.99 
 
 
426 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.58 
 
 
441 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.57 
 
 
407 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.71 
 
 
405 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  33.84 
 
 
455 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  34.93 
 
 
444 aa  166  7e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.06 
 
 
433 aa  165  1e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.83 
 
 
408 aa  163  5e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  30.21 
 
 
437 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.7 
 
 
434 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  32.19 
 
 
432 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  31.16 
 
 
407 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  33.83 
 
 
415 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  35.51 
 
 
409 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  35.51 
 
 
409 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  35.51 
 
 
409 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.09 
 
 
426 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.21 
 
 
421 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.39 
 
 
391 aa  154  3e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  31.54 
 
 
390 aa  153  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.46 
 
 
401 aa  152  9e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.42 
 
 
419 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  34.86 
 
 
423 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.51 
 
 
408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.51 
 
 
408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>