More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1523 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  76.02 
 
 		 473 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  79.74 
 
 		 474 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 		 473 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  70.15 
 
 		 496 aa  674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  72.34 
 
 		 473 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  71.58 
 
 		 473 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 		 473 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  70.24 
 
 		 473 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  91.56 
 
 		 474 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  80.6 
 
 		 474 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  80.85 
 
 		 475 aa  763    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  72.34 
 
 		 473 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  70.73 
 
 		 474 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  82.09 
 
 		 474 aa  769    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  98.95 
 
 		 474 aa  934    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  71.91 
 
 		 473 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  72.3 
 
 		 491 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  72.49 
 
 		 474 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  71.97 
 
 		 471 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 475 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  947    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 		 476 aa  631  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  65.11 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 487 aa  525  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 490 aa  518  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 471 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 469 aa  425  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 470 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 468 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 475 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  402  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>