More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1504 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 341 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  91.5 
 
 		 346 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  78.3 
 
 		 341 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  75.95 
 
 		 341 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  60.06 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  57.18 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  57.52 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  52.94 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  42.01 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  44.35 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  45.53 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  43.77 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  45.53 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  44.96 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  44.38 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  44.38 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  44.38 
 
 		 340 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  49.85 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  44.15 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  44.76 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  42.94 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  43.97 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  43.62 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.82 
 
 		 340 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  45.82 
 
 		 340 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  45.53 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.53 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.53 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.53 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.53 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  46.53 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  44.19 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  46.53 
 
 		 345 aa  259  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  42.94 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  43.15 
 
 		 361 aa  255  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  45.24 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  41.57 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  42.39 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  42.03 
 
 		 342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  40.99 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  45.82 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  44.09 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  40.41 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  46.36 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  45.91 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  45.91 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  41.52 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  46.06 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  45.61 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  41.98 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  46.06 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  42.82 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  45.91 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  45.91 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  45.61 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  44.79 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  45.51 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  43.9 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  45.32 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  44.35 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  44.77 
 
 		 343 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 342 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  45.35 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  44.12 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  41.01 
 
 		 582 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  38.78 
 
 		 577 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  37.43 
 
 		 578 aa  198  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  34.14 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  38.04 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  43.04 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  40.77 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  44.95 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  41.59 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  44.5 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  40.93 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  41.78 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.73 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  42.06 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  44.44 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.31 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  37.77 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  41.41 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.5 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  39.23 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.91 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  42.4 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  42.86 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  43.24 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  44.56 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>