More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1362 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
272 aa  507  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  90.44 
 
 
277 aa  410  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.42 
 
 
276 aa  324  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.79 
 
 
277 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.42 
 
 
277 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.04 
 
 
277 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.18 
 
 
278 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.54 
 
 
273 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.88 
 
 
301 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.78 
 
 
273 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.57 
 
 
273 aa  258  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.04 
 
 
276 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.09 
 
 
266 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.67 
 
 
281 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.3 
 
 
277 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.51 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.44 
 
 
281 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.02 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.64 
 
 
275 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.68 
 
 
275 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.59 
 
 
293 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.08 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
273 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.43 
 
 
271 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.21 
 
 
269 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.01 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
273 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.53 
 
 
273 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.74 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 
269 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
272 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
272 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
272 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
270 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 
280 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 
273 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 
272 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.04 
 
 
264 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 
300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.52 
 
 
280 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.79 
 
 
255 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
272 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
272 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
271 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
271 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 
260 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 
268 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.15 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
274 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
275 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
269 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
282 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.81 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 
264 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.83 
 
 
268 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  41.04 
 
 
262 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  41.04 
 
 
262 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
277 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.85 
 
 
267 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
278 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
271 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.08 
 
 
270 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.77 
 
 
272 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
289 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
274 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.01 
 
 
280 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.24 
 
 
276 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
271 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
267 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
274 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.57 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
282 aa  152  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.65 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
270 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.69 
 
 
276 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.21 
 
 
267 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  38.24 
 
 
283 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
279 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 
284 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
273 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
262 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
271 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
272 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.8 
 
 
275 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.8 
 
 
275 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
267 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>