29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1359 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  64.35 
 
 
115 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  51.75 
 
 
115 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  48.28 
 
 
112 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  48.65 
 
 
114 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  48.18 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  44.74 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  41.23 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  42.98 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  42.98 
 
 
201 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  42.98 
 
 
198 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  39.09 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  36.21 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  40.54 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  39.64 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  36.21 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  35.14 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  35.45 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  35.45 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  35.45 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  34.55 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  34.55 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  34.55 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>