266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1343 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
279 aa  547  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  83.67 
 
 
257 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.62 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.94 
 
 
328 aa  271  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.94 
 
 
328 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.62 
 
 
246 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.82 
 
 
266 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.97 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.44 
 
 
242 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.84 
 
 
837 aa  228  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.2 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  46.15 
 
 
245 aa  212  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.15 
 
 
242 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.11 
 
 
808 aa  194  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.89 
 
 
249 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.3 
 
 
249 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.39 
 
 
260 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.21 
 
 
261 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.39 
 
 
261 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 
244 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 
253 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.34 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.16 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.32 
 
 
226 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 
228 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.63 
 
 
285 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 
264 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.48 
 
 
285 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.98 
 
 
285 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  35.27 
 
 
273 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.35 
 
 
258 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.24 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.24 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.1 
 
 
246 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
281 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.45 
 
 
232 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.73 
 
 
259 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
236 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 
271 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.13 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.5 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.82 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.13 
 
 
269 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 
271 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
338 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  31.17 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.1 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
247 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.77 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.58 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  35.92 
 
 
617 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.25 
 
 
1153 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.47 
 
 
299 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.99 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.27 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  34.94 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
231 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 
243 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.58 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.81 
 
 
639 aa  82  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.18 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.77 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.77 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.42 
 
 
591 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  31.37 
 
 
673 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.73 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.3 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  33.08 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  35.08 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.88 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.88 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  31.47 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>