More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1333 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
270 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  81.75 
 
 
276 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  60.54 
 
 
267 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  55.46 
 
 
262 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.22 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  43.1 
 
 
242 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  43.1 
 
 
242 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  45 
 
 
259 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 
256 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.81 
 
 
243 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  38.72 
 
 
255 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  40.74 
 
 
256 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  41.42 
 
 
256 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  37.83 
 
 
264 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  41.67 
 
 
323 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  37.34 
 
 
241 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  42.44 
 
 
425 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  40.35 
 
 
236 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  41.08 
 
 
394 aa  146  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  38.74 
 
 
325 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  37.31 
 
 
417 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  40.76 
 
 
234 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  41.67 
 
 
274 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  40.5 
 
 
234 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  40.89 
 
 
467 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.61 
 
 
247 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.13 
 
 
242 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  42.29 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
238 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.34 
 
 
243 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  36.84 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  40.73 
 
 
558 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  34.9 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 
395 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.93 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  40.43 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
239 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  39.48 
 
 
449 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.02 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.66 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  31.37 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  40.4 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.71 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.45 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.09 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.06 
 
 
470 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
250 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  40.53 
 
 
469 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40.61 
 
 
567 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.91 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  37.66 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  37.23 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.75 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  32.57 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  38.79 
 
 
477 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  35.41 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.84 
 
 
597 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  35.9 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 
271 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  38.24 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  36.72 
 
 
574 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.17 
 
 
261 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.55 
 
 
271 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  33.61 
 
 
239 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.63 
 
 
242 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  38.7 
 
 
364 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  33.2 
 
 
239 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  40.76 
 
 
514 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  38.1 
 
 
463 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  35.58 
 
 
269 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  39.82 
 
 
505 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  34.18 
 
 
293 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.19 
 
 
611 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.94 
 
 
421 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.84 
 
 
404 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.51 
 
 
274 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
540 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  37.13 
 
 
264 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  35.6 
 
 
426 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  38.67 
 
 
256 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  39.46 
 
 
266 aa  121  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  36.75 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  32.44 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.17 
 
 
239 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
241 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  40.34 
 
 
270 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  38.65 
 
 
255 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
538 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  35.9 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  35.9 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1295  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
500 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
548 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  36.84 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>