More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1260 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  100 
 
 		 331 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  91.84 
 
 		 331 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  73.21 
 
 		 337 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  74.4 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  74.7 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  73.21 
 
 		 337 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  64.13 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  62.95 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  61.35 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  62.96 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  61.52 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  60.61 
 
 		 333 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  58.18 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  60 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  58.48 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  56.23 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  56.23 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  58.79 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  55.21 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  53.94 
 
 		 331 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  57.78 
 
 		 407 aa  341  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  55.86 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  53.17 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 330 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  50.15 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  51.86 
 
 		 337 aa  318  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  51.23 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  51.66 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  48.62 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  51.85 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  51.06 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  45 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.31 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  49.39 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  48.46 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.3 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  47.73 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  53.33 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  48.63 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  50.46 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  48.33 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  39.94 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  38.27 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  39.75 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  44.58 
 
 		 330 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  39.75 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  46.06 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.09 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  45.16 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  43.21 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  36.79 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.4 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  39.51 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  32.62 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  35.26 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  32.72 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  33.75 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.96 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.27 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.27 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  34.88 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.16 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  35.61 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.9 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  36.64 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  35.04 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  32.71 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  31.17 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.47 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  29.26 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.67 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.88 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  30.8 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  32.63 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  31.64 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  30.25 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.59 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  30.25 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  30.25 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  30.25 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  30.25 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  32.1 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.44 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.95 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  23.46 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  27.04 
 
 		 630 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  29.92 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>