More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1231 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  100 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  84.7 
 
 
304 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  67 
 
 
309 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  66.34 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  69.89 
 
 
317 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  68.86 
 
 
301 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  49.45 
 
 
306 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  48.82 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  49.63 
 
 
305 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  43.26 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  48.69 
 
 
301 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  39.48 
 
 
312 aa  255  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  46.15 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  42.35 
 
 
308 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  44.67 
 
 
316 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
314 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  45.82 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  46.32 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  45.02 
 
 
307 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  48.59 
 
 
323 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  44.03 
 
 
271 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  45.36 
 
 
331 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40.32 
 
 
345 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  44.1 
 
 
310 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  42.11 
 
 
307 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  42.66 
 
 
303 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  40.2 
 
 
302 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
272 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  42.05 
 
 
305 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
305 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  37.45 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
271 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  26.82 
 
 
409 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  26.16 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  33.18 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  32.54 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  32.08 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.14 
 
 
321 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  27.53 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  34.2 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  29.35 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  28.63 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  28.03 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  28.02 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  27.22 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  30.59 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.65 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.15 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  28.95 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  27.22 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.15 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.15 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  28.29 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  23.45 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  27.72 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  26.73 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  26.13 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  30.85 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  31.06 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.96 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  23.41 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.96 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.96 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  30.57 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  29.68 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.16 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0491  aldo/keto reductase  33.9 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00588566  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  30.05 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  29.15 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  27.57 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  29.15 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  26.34 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  28.34 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  33.66 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  29.81 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  31.45 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  31.98 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  23.17 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.4 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>