176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1227 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 
316 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  87.62 
 
 
320 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  79.37 
 
 
315 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  71.47 
 
 
312 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  49.21 
 
 
313 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  49.84 
 
 
318 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  47.94 
 
 
315 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  46.65 
 
 
321 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  46.45 
 
 
321 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  46.13 
 
 
316 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  42.19 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  41.85 
 
 
315 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  36.96 
 
 
347 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  36.79 
 
 
438 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  36.48 
 
 
438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  37.61 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  34.25 
 
 
360 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  36.16 
 
 
379 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  35.05 
 
 
484 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  35.65 
 
 
373 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  34.19 
 
 
439 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  39.76 
 
 
328 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  34.12 
 
 
359 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.94 
 
 
343 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  34.11 
 
 
343 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  33.63 
 
 
345 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  32.95 
 
 
498 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.84 
 
 
358 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  32.73 
 
 
456 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  36.98 
 
 
319 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.83 
 
 
416 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.83 
 
 
416 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  36.98 
 
 
319 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  31.83 
 
 
416 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  36.3 
 
 
305 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.98 
 
 
319 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  36.34 
 
 
363 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  35.5 
 
 
298 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.58 
 
 
791 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  30.83 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  36.7 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  31.1 
 
 
491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.51 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  30.83 
 
 
479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  35.48 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  35.22 
 
 
322 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.07 
 
 
479 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
483 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.38 
 
 
791 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  35.05 
 
 
312 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.41 
 
 
312 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 
844 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.98 
 
 
481 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  36.31 
 
 
412 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  36.08 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  28.88 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 
777 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
810 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  31.92 
 
 
443 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 
454 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.69 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  36.9 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
791 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  35 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.08 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.38 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  31.94 
 
 
300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  30.79 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  29.93 
 
 
304 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  34.1 
 
 
337 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  30.95 
 
 
304 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  32.27 
 
 
350 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  34.59 
 
 
314 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.67 
 
 
303 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  35.14 
 
 
337 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  35.97 
 
 
337 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  30.41 
 
 
304 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  37.02 
 
 
314 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  32.78 
 
 
303 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  31.37 
 
 
339 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.95 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.95 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  32.37 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  33.67 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  29.73 
 
 
304 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  36.63 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  32.33 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  33.99 
 
 
337 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  33.99 
 
 
337 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  29.39 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  33.99 
 
 
366 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  35.43 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.04 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  27.81 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  35.55 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.13 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  33.79 
 
 
304 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  34.3 
 
 
305 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  30.9 
 
 
285 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>