254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1169 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 353 aa  708    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  91.22 
 
 		 353 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  50.86 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  54.76 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  55.27 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  51.12 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  48.59 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  53.14 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  46.4 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  50.29 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.01 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  46.97 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  46.13 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  46.18 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  45.58 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  48.28 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  48.13 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  44.13 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  44.32 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  48.03 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  43.55 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  43.84 
 
 		 349 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  48.85 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  51.46 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  44.99 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  43.8 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  43.79 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  44.92 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  43.77 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  47.1 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  43.34 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  43.34 
 
 		 346 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  43.79 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  47.13 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  46.6 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  44.98 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  46.77 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  43.87 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  43.87 
 
 		 346 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  45.14 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  44.84 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  45.48 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  39.13 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  43.55 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  41.81 
 
 		 348 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  41.97 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  44.84 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  43.77 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  40 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  45.16 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  43.55 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  41.69 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  40.34 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  42.98 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.69 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  46.45 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  46.13 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  42.9 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  46.13 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  42.57 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  39.94 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  41.74 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  42.57 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  41.86 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  42.15 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  41.86 
 
 		 371 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  40.4 
 
 		 364 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  40.34 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  39.53 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  39.88 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  38.95 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  41.04 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  42.23 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  43.35 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  40.48 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  39.77 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  41.86 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  38.15 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  41.45 
 
 		 375 aa  203  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  38.86 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  40.18 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  43.75 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  39.83 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  39.83 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  39.55 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.75 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  38.97 
 
 		 350 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  43.25 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  42.49 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  44.41 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  38.04 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  35.86 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  30.57 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  29.33 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  30.75 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  30.2 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  30.11 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  27.04 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  25.71 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  27.92 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>