221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1086 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  100 
 
 
345 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  94.48 
 
 
326 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  82.8 
 
 
346 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  84.31 
 
 
329 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  85.23 
 
 
329 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  83.28 
 
 
328 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  70.65 
 
 
330 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  69.21 
 
 
329 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  68.94 
 
 
330 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  68.57 
 
 
330 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  68.06 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  69.77 
 
 
326 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  69.01 
 
 
328 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  68.39 
 
 
326 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  61.95 
 
 
333 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  62.46 
 
 
333 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  61.71 
 
 
332 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  61.3 
 
 
329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  62.5 
 
 
332 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  58.6 
 
 
331 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  58.31 
 
 
343 aa  358  9e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  59.56 
 
 
332 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  60.13 
 
 
325 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  60.13 
 
 
325 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  60.13 
 
 
325 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  59.94 
 
 
331 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  56.72 
 
 
372 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  60.19 
 
 
322 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  59.73 
 
 
347 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  60.32 
 
 
372 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  59.57 
 
 
364 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  59.62 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  54.69 
 
 
329 aa  340  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  60.06 
 
 
328 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  58.73 
 
 
329 aa  338  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  48.8 
 
 
363 aa  332  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  58.98 
 
 
378 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  58.98 
 
 
380 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  54.79 
 
 
329 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  59.65 
 
 
346 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  59.32 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  53.31 
 
 
374 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  55.17 
 
 
342 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  52.5 
 
 
352 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  56.29 
 
 
334 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  55.95 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  52.56 
 
 
359 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  57.99 
 
 
322 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  52.72 
 
 
382 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  54.75 
 
 
321 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  51.47 
 
 
366 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  51.64 
 
 
345 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  54.11 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  57.33 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  50.84 
 
 
343 aa  312  5.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  55.31 
 
 
340 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  53.05 
 
 
337 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  57.29 
 
 
351 aa  309  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  51.96 
 
 
373 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  57.05 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  52.73 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  53.87 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  53.36 
 
 
381 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  51.78 
 
 
332 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  52.05 
 
 
351 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  54.04 
 
 
345 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  48.81 
 
 
343 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  51.23 
 
 
331 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  51.23 
 
 
331 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  51.23 
 
 
331 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  51.23 
 
 
331 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  51.23 
 
 
331 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  49.05 
 
 
343 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  50.88 
 
 
331 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  50.88 
 
 
331 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  50.88 
 
 
331 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  50.18 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  44.51 
 
 
337 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  53.68 
 
 
341 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  46.35 
 
 
334 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  44.09 
 
 
336 aa  272  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  45.19 
 
 
335 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  44.23 
 
 
341 aa  268  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  53.8 
 
 
337 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  53.38 
 
 
341 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  47.89 
 
 
358 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  52.19 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  52.19 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  51.44 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  46.93 
 
 
337 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  51.96 
 
 
333 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  47.64 
 
 
303 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  43.85 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  39.15 
 
 
312 aa  203  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  42.2 
 
 
312 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  44.79 
 
 
356 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  40.91 
 
 
316 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  38.65 
 
 
325 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  43.46 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  46.03 
 
 
329 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>