261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1068 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  81.9 
 
 
210 aa  336  1e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  71.07 
 
 
207 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.932005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.69 
 
 
214 aa  267  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0765  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.68 
 
 
213 aa  265  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0705195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.38 
 
 
212 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.67 
 
 
213 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4664  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  66.67 
 
 
214 aa  261  5e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4295  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  66.15 
 
 
214 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.18 
 
 
213 aa  258  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1389  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.19 
 
 
212 aa  257  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1136  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.07 
 
 
213 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0531  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.17 
 
 
216 aa  253  1e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.02 
 
 
212 aa  251  5e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62 
 
 
208 aa  251  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.69 
 
 
206 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1088  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.18 
 
 
204 aa  250  8e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2463  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60 
 
 
216 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.58 
 
 
208 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.69 
 
 
206 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.71 
 
 
206 aa  247  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0857  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.28 
 
 
222 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.55 
 
 
233 aa  244  5e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4754  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.16 
 
 
200 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1157  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.5 
 
 
209 aa  241  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.42 
 
 
212 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.7 
 
 
206 aa  238  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.86 
 
 
201 aa  237  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1108  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.94 
 
 
208 aa  233  1e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.536628  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0654  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.96 
 
 
216 aa  233  2e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.273077  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0678  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.81 
 
 
213 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0790  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.49 
 
 
208 aa  232  4e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.150003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0048  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.69 
 
 
203 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.38 
 
 
218 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.73 
 
 
215 aa  225  5e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.2 
 
 
213 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.93 
 
 
202 aa  214  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.67 
 
 
211 aa  214  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.42 
 
 
193 aa  213  2e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.65 
 
 
211 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.21 
 
 
214 aa  207  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.37 
 
 
211 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.97 
 
 
211 aa  205  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.56 
 
 
229 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.33 
 
 
214 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.72 
 
 
212 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.33 
 
 
214 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.33 
 
 
214 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0858  pyridoxamine-phosphate oxidase  55.28 
 
 
220 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911658  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.82 
 
 
265 aa  201  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.74 
 
 
212 aa  200  1e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.45 
 
 
214 aa  200  1e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.72 
 
 
212 aa  200  1e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.65 
 
 
214 aa  199  2e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.65 
 
 
214 aa  199  2e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.65 
 
 
214 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2345  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.97 
 
 
200 aa  198  4e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.04 
 
 
213 aa  198  4e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.6 
 
 
215 aa  197  1e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1020  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.45 
 
 
200 aa  197  1e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137721  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.82 
 
 
218 aa  196  2e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.82 
 
 
218 aa  196  2e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.31 
 
 
214 aa  196  2e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.96 
 
 
214 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.88 
 
 
215 aa  194  8e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.46 
 
 
212 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.08 
 
 
211 aa  193  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.08 
 
 
213 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.6 
 
 
214 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1789  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.69 
 
 
201 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00011634  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.91 
 
 
214 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.47 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1052  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.88 
 
 
200 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.12 
 
 
224 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1988  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.43 
 
 
196 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  normal  0.0355751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.56 
 
 
213 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.62 
 
 
217 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.97 
 
 
212 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.04 
 
 
215 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.31 
 
 
215 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.46 
 
 
212 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.83 
 
 
214 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2475  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.55 
 
 
206 aa  189  3e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102902  normal  0.0239297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.93 
 
 
218 aa  188  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.11 
 
 
212 aa  188  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1455  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.87 
 
 
198 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.89 
 
 
212 aa  188  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.58 
 
 
217 aa  188  6e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3033  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.21 
 
 
199 aa  187  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.312491  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.28 
 
 
225 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.31 
 
 
239 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.83 
 
 
217 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.58 
 
 
215 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.05 
 
 
217 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.84 
 
 
218 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.84 
 
 
218 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>