225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1059 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  90.07 
 
 
282 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  73.85 
 
 
283 aa  407  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  71.73 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  71.73 
 
 
283 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  68.93 
 
 
283 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  73.76 
 
 
282 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  68.79 
 
 
282 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  62.45 
 
 
282 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  53.47 
 
 
293 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  55.48 
 
 
290 aa  298  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  54.7 
 
 
299 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  52.35 
 
 
283 aa  292  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  53.96 
 
 
283 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  52.33 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  48.74 
 
 
283 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  48.8 
 
 
290 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  45.45 
 
 
313 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  42.76 
 
 
289 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  42.05 
 
 
289 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  43.77 
 
 
290 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  42.55 
 
 
286 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  42.29 
 
 
286 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  43.53 
 
 
290 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  43.53 
 
 
290 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  42.29 
 
 
286 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  42.29 
 
 
286 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  43.17 
 
 
290 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  42.81 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  46.44 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  43.17 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0164755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  41.94 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  41.94 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  43.17 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  41.94 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  41.94 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  41.94 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  41.94 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  42.81 
 
 
288 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  41.22 
 
 
286 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  41.37 
 
 
286 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  41.22 
 
 
286 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  41.22 
 
 
286 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  41.22 
 
 
286 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  41.22 
 
 
286 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  42.45 
 
 
288 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  41.01 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  40.5 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  41.24 
 
 
287 aa  211  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  40.29 
 
 
286 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  39.43 
 
 
286 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  42.09 
 
 
296 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  41.2 
 
 
286 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  42.45 
 
 
354 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  42.09 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  42.09 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  41.73 
 
 
286 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  42.45 
 
 
287 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  42.45 
 
 
287 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  42.45 
 
 
309 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  41.73 
 
 
312 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  41.73 
 
 
286 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  41.73 
 
 
286 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  41.73 
 
 
286 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  42.45 
 
 
309 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  42.09 
 
 
287 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  40.94 
 
 
287 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  42.09 
 
 
309 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  41.73 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  40.65 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  36.46 
 
 
289 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  42.53 
 
 
288 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  39.46 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  39.08 
 
 
288 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  36.86 
 
 
287 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  44.85 
 
 
298 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  34.72 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  38.46 
 
 
278 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  41.04 
 
 
280 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  37.5 
 
 
282 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  39.19 
 
 
289 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  40 
 
 
291 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  35.63 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  33.58 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  36.87 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  35.63 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  32.48 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  41.18 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  31.43 
 
 
291 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  31.07 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  31.42 
 
 
278 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  33.88 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  29.12 
 
 
283 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  29.12 
 
 
283 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  29.12 
 
 
283 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  29.12 
 
 
283 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  29.12 
 
 
283 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  28.74 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  28.74 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>