More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1017 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  94.74 
 
 		 228 aa  443  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  81.14 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.26 
 
 		 228 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  80.26 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.82 
 
 		 228 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  68.86 
 
 		 228 aa  330  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.23 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  64.41 
 
 		 227 aa  315  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  64.41 
 
 		 227 aa  315  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  64.41 
 
 		 227 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  65.94 
 
 		 228 aa  315  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 228 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.47 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  62.72 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  64.86 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  64.86 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  63.56 
 
 		 227 aa  297  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.72 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  61.67 
 
 		 228 aa  295  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.72 
 
 		 227 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 228 aa  294  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  60.62 
 
 		 256 aa  289  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  60.35 
 
 		 228 aa  288  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  59.47 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  66.04 
 
 		 232 aa  286  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  60.79 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  63.16 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  60.79 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.31 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  52.91 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.47 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  41.05 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.98 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  34.78 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  36.05 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  35.42 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  38.2 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  38.33 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  41.7 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.39 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  35.15 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.08 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.11 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  38.26 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  34.68 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  40.09 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.11 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  38.5 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>