More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0825 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
364 aa  725    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  56.3 
 
 
376 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 
335 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 
332 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  35.76 
 
 
332 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  36.08 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  36.08 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  36.08 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  36.08 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  36.08 
 
 
332 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2801  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
332 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4212  putative hydrolase, alpha/beta fold family  36.08 
 
 
332 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1025  putative hydrolase, alpha/beta fold family  36.08 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3934  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
332 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.870458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4164  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 
356 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
364 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
378 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 
343 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  30.72 
 
 
343 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  30.72 
 
 
343 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 
343 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 
343 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 
343 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4419  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
399 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582229  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
347 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4017  proline imino-peptidase  26.81 
 
 
353 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  30.85 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  26.71 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  25.24 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  40.16 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0279  hypothetical protein  21.9 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0626253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  31.52 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  35.71 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.63 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  34.29 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  34.29 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  34.29 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  37.9 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  34.85 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  34.29 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  36.29 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  34.29 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  39.17 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  42.31 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.69 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  26.33 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  36.29 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  26.52 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  35.56 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  31.54 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  36.64 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  37.1 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  40.38 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  36.88 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  37.88 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  37.9 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  37.9 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  37.9 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  33.99 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  33.59 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  35.29 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  35.58 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  35.48 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  32.16 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  35.48 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  34.68 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  35.48 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  35.29 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
302 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.37 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  37.5 
 
 
323 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  33.91 
 
 
303 aa  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
297 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  23.49 
 
 
301 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
297 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.56 
 
 
276 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  36.54 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  36.54 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  31.82 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  37.5 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  32.81 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  33.61 
 
 
320 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  35.48 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  34.4 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  36.54 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  32.28 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>