More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0712 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.37 
 
 		 643 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 605 aa  1191    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  84.46 
 
 		 606 aa  958    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.1 
 
 		 646 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  60.28 
 
 		 648 aa  653    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.21 
 
 		 630 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 627 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 		 614 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 610 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 607 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 612 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 583 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  42.03 
 
 		 525 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  43.9 
 
 		 609 aa  246  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  43.6 
 
 		 609 aa  243  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 513 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 614 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  42.26 
 
 		 503 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  40.23 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 661 aa  220  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 775 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  44.94 
 
 		 771 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 911 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 844 aa  203  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  44.53 
 
 		 771 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 579 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 717 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 617 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 769 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  42.01 
 
 		 774 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  44.13 
 
 		 288 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 562 aa  195  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1352 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 774 aa  193  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1046 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  43.33 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 600 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  43.75 
 
 		 511 aa  191  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  43.33 
 
 		 532 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  44 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  44 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 778 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 513 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 686 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  41.98 
 
 		 783 aa  187  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  41.98 
 
 		 783 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 531 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 582 aa  187  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 536 aa  186  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 798 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  38.82 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 530 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  42.03 
 
 		 513 aa  185  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 765 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 708 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 523 aa  183  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 468 aa  183  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 700 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 775 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  36.9 
 
 		 693 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1322 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 970 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 973 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 1192 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 782 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 836 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 770 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 827 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 841 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  37.87 
 
 		 1035 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 779 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  38.13 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 389 aa  177  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 764 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 646 aa  177  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 573 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1055 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 917 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 767 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  41.67 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 772 aa  174  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>