More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0633 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  85.41 
 
 
435 aa  715    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  87.29 
 
 
192 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  66.81 
 
 
243 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5532  hypothetical protein  88.82 
 
 
193 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  37.91 
 
 
449 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  82.71 
 
 
144 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  71.01 
 
 
184 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4333  transposase  72.12 
 
 
106 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  27.48 
 
 
492 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  27.54 
 
 
492 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  26 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  27.83 
 
 
448 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  27.83 
 
 
448 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  27.83 
 
 
448 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  27.83 
 
 
448 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  27.83 
 
 
448 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  27.83 
 
 
448 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  25.68 
 
 
493 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  25.45 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  26.92 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  26.04 
 
 
492 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  28.51 
 
 
424 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  27.69 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  28.05 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  27.69 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  27.63 
 
 
482 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  27.46 
 
 
482 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  27.59 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  27.59 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  27.59 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  27.59 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  27.39 
 
 
503 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  27.36 
 
 
482 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  28.06 
 
 
483 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  34.58 
 
 
238 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  35.4 
 
 
248 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  29.43 
 
 
329 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  26.96 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  23.47 
 
 
506 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  23.22 
 
 
506 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1518  hypothetical protein  40.16 
 
 
138 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0425914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  24.87 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  26.61 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  27.71 
 
 
546 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  27.85 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2795  transposase IS66  26.09 
 
 
532 aa  77  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1224  transposase IS66  25.91 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.321237  normal  0.0414458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  27.25 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1376  transposase IS66  25.91 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154743  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3451  hypothetical protein  90 
 
 
74 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>