More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0506 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  58.11 
 
 		 815 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  57.9 
 
 		 814 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  83.83 
 
 		 810 aa  1201    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  57.3 
 
 		 830 aa  732    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  57.58 
 
 		 830 aa  736    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 796 aa  1557    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  49.5 
 
 		 750 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  49.14 
 
 		 728 aa  515  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  48.09 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  49.66 
 
 		 714 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  47.99 
 
 		 763 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  46.6 
 
 		 626 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  45.49 
 
 		 727 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  45.64 
 
 		 727 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  46.18 
 
 		 728 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  47.67 
 
 		 658 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  48.48 
 
 		 775 aa  492  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  46.01 
 
 		 739 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  47.22 
 
 		 735 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  47.46 
 
 		 720 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  46.21 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  47.68 
 
 		 757 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  45.04 
 
 		 732 aa  475  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  46.62 
 
 		 734 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  45.09 
 
 		 734 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  47.13 
 
 		 741 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  47.07 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.86 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  45.06 
 
 		 770 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  45.76 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  47.47 
 
 		 712 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  48.69 
 
 		 626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  45.58 
 
 		 776 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  45.63 
 
 		 723 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  48.13 
 
 		 727 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  44.71 
 
 		 730 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  44.71 
 
 		 763 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  41.52 
 
 		 768 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  47.04 
 
 		 651 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  45.31 
 
 		 750 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  43.27 
 
 		 759 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  42.7 
 
 		 759 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  42.68 
 
 		 760 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  43.7 
 
 		 699 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  42.65 
 
 		 769 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  43.27 
 
 		 757 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  42.7 
 
 		 750 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  40.78 
 
 		 758 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  42.64 
 
 		 718 aa  429  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  43.52 
 
 		 732 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  44.83 
 
 		 669 aa  429  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  43.74 
 
 		 744 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  41.54 
 
 		 742 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  46.26 
 
 		 656 aa  416  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  42.24 
 
 		 724 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  41.87 
 
 		 718 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  41.46 
 
 		 712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  40.73 
 
 		 707 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  41.34 
 
 		 724 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 764 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.43 
 
 		 712 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  41.87 
 
 		 714 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  43.01 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 		 765 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  39.71 
 
 		 784 aa  399  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  42.5 
 
 		 654 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  38.26 
 
 		 648 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  43.76 
 
 		 733 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  43.44 
 
 		 736 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  43.25 
 
 		 728 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  39.18 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  40.46 
 
 		 788 aa  386  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  42.6 
 
 		 831 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  41.71 
 
 		 788 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.58 
 
 		 776 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  40.71 
 
 		 735 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  39.93 
 
 		 811 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.07 
 
 		 712 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  41.68 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  38.89 
 
 		 729 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.6 
 
 		 755 aa  364  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  42.29 
 
 		 761 aa  360  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.29 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.29 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.75 
 
 		 626 aa  357  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.64 
 
 		 643 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 		 776 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.14 
 
 		 824 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.86 
 
 		 668 aa  352  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  38.97 
 
 		 824 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.81 
 
 		 727 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 		 654 aa  340  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.16 
 
 		 692 aa  340  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  40.61 
 
 		 801 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  39.12 
 
 		 806 aa  339  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.42 
 
 		 727 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.31 
 
 		 640 aa  338  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.12 
 
 		 661 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  36.9 
 
 		 744 aa  336  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>