More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0484 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
2668 aa  5344    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.38 
 
 
2105 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  88.85 
 
 
460 aa  444  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  83.78 
 
 
460 aa  436  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  68.49 
 
 
980 aa  403  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  57.65 
 
 
615 aa  306  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  55.39 
 
 
341 aa  284  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.58 
 
 
1795 aa  277  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  51.1 
 
 
526 aa  275  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.56 
 
 
1027 aa  267  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 
341 aa  263  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  61.37 
 
 
686 aa  253  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.27 
 
 
419 aa  243  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.82 
 
 
419 aa  243  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  53.06 
 
 
363 aa  240  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.25 
 
 
389 aa  238  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191864  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38180  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.6 
 
 
396 aa  236  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.23 
 
 
379 aa  235  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.77 
 
 
406 aa  233  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.57 
 
 
355 aa  233  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0235433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0393  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.96 
 
 
379 aa  233  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.76423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.48 
 
 
1372 aa  229  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.69 
 
 
392 aa  228  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0502  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic precursor protein  42.28 
 
 
378 aa  228  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3194  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  40.22 
 
 
378 aa  228  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  40.22 
 
 
378 aa  226  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.830481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3256  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.81 
 
 
381 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.95 
 
 
378 aa  225  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3140  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39.95 
 
 
378 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2022  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39.95 
 
 
378 aa  225  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.779674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.12 
 
 
383 aa  224  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39.95 
 
 
378 aa  225  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0892  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39.95 
 
 
378 aa  225  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39.95 
 
 
378 aa  225  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2432  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.95 
 
 
390 aa  224  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0322751  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4105  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.76 
 
 
381 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4261  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.76 
 
 
381 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.036739  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4329  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.89 
 
 
381 aa  223  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00293344  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4158  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.49 
 
 
381 aa  223  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.26 
 
 
370 aa  221  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1750  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.95 
 
 
381 aa  220  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102428  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic  40.79 
 
 
383 aa  220  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000316579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.05 
 
 
383 aa  219  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3685  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.22 
 
 
381 aa  219  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 
385 aa  219  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.66 
 
 
2667 aa  217  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.95 
 
 
377 aa  215  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12050  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.8 
 
 
425 aa  214  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0051177  normal  0.272152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6906  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.16 
 
 
381 aa  214  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3422  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.44 
 
 
396 aa  212  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2756  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.44 
 
 
396 aa  212  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0237  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.14 
 
 
412 aa  210  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.3 
 
 
368 aa  209  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1298  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.43 
 
 
399 aa  206  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120956  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.63 
 
 
373 aa  206  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.08 
 
 
1016 aa  204  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4038  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.67 
 
 
371 aa  199  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.690604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.16 
 
 
395 aa  197  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.57 
 
 
397 aa  196  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.11 
 
 
360 aa  196  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.9 
 
 
769 aa  196  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03494  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.63 
 
 
366 aa  194  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50.56 
 
 
946 aa  194  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7923  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.68 
 
 
358 aa  194  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.49 
 
 
350 aa  192  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4172  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.95 
 
 
333 aa  191  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536145  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0245  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.41 
 
 
332 aa  191  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.710509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  37.12 
 
 
357 aa  191  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.98 
 
 
1236 aa  187  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.94 
 
 
2145 aa  187  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.49 
 
 
369 aa  186  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.59 
 
 
9867 aa  186  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01400  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.23 
 
 
408 aa  186  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.32 
 
 
1164 aa  185  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.57 
 
 
1279 aa  184  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2384  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.57 
 
 
374 aa  184  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0398882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  44.41 
 
 
1712 aa  181  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 
1534 aa  180  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.14 
 
 
3427 aa  180  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  46.48 
 
 
1287 aa  179  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1046  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.61 
 
 
375 aa  179  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.96 
 
 
2954 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.43 
 
 
2775 aa  175  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1401  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.5 
 
 
329 aa  174  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  41.99 
 
 
595 aa  172  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.81 
 
 
1532 aa  170  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.15 
 
 
1424 aa  169  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0859  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.63 
 
 
356 aa  168  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.8 
 
 
1363 aa  168  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  43.92 
 
 
833 aa  167  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.12 
 
 
359 aa  165  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482615  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3369  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.18 
 
 
381 aa  164  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  42.16 
 
 
1895 aa  164  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  35.6 
 
 
613 aa  164  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2633  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.97 
 
 
367 aa  164  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  44.28 
 
 
491 aa  163  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 
3954 aa  161  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  38.34 
 
 
3619 aa  159  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.41 
 
 
341 aa  159  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.46 
 
 
3619 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>