More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0471 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
422 aa  824    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  82.94 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  62.5 
 
 
434 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  63.21 
 
 
434 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  63.73 
 
 
443 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  58.17 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
423 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 
421 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 
424 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
422 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
448 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
410 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
403 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
392 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
401 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
394 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
410 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
415 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
414 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  29.11 
 
 
384 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
426 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
391 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.58 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
393 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
445 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.82 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.1 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  28.41 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  37.93 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  39.61 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  26.62 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  36.99 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
904 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  20.25 
 
 
778 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.42 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0856  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.609442 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.33 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
816 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
387 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
377 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
377 aa  60.1  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
539 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.56 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2690  group 1 glycosyl transferase  33.9 
 
 
378 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.823218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.26 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  34.93 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  32.4 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>