More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0470 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  73.26 
 
 		 488 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  74.13 
 
 		 494 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  73.38 
 
 		 504 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  100 
 
 		 471 aa  926    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  73.26 
 
 		 488 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  91.93 
 
 		 471 aa  825    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  60.22 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  58.74 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  56.49 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  56.72 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  57.4 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  56.21 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  57.4 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  55.14 
 
 		 480 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  55.91 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  56.01 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  53.52 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  49.78 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  50 
 
 		 465 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  50.88 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  50.88 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  49.89 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  48.16 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  48.07 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  50.46 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  48.87 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  49.44 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  45.98 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  47.67 
 
 		 474 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  43.05 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  43.05 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  43.44 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  40.3 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.14 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.51 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.57 
 
 		 479 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.38 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.39 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  41.44 
 
 		 450 aa  287  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  36.42 
 
 		 472 aa  286  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  41.65 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  41.65 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  41.65 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42.15 
 
 		 451 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.79 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  40.97 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  40.04 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  50.64 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.59 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  42.67 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.04 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.04 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.67 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.95 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  48.65 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.13 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  35.63 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  40.47 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  41.29 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.96 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  37.44 
 
 		 496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.45 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  42.41 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.06 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  39.57 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.42 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  37.34 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  37.22 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.15 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  44.57 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.39 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.8 
 
 		 450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.58 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.64 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.6 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  47.48 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.41 
 
 		 483 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.61 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.35 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.85 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  51.03 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  36.94 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  39.14 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  39.91 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.79 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.65 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.83 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  38.64 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  36.94 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  36.94 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  36.94 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  36.94 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  36.94 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  36.94 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  50.52 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.25 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  44.51 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.2 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.28 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>