More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0464 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  100 
 
 
335 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  88.32 
 
 
335 aa  607  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  74.1 
 
 
336 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  72.37 
 
 
336 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  72.37 
 
 
336 aa  494  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  71.13 
 
 
336 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  71.99 
 
 
337 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  65.66 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  66.46 
 
 
328 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  59.04 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.3 
 
 
334 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 
334 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.08 
 
 
332 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.96 
 
 
331 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  56.8 
 
 
332 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  54.08 
 
 
335 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  58.66 
 
 
328 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  59.76 
 
 
328 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  58.97 
 
 
328 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  55.93 
 
 
389 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.02 
 
 
338 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.01 
 
 
327 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 
332 aa  360  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
333 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  57.01 
 
 
328 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.39 
 
 
332 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  58.23 
 
 
333 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
332 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.1 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  56.71 
 
 
328 aa  355  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  57.45 
 
 
333 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.89 
 
 
334 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.88 
 
 
332 aa  354  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.92 
 
 
332 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.92 
 
 
332 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.39 
 
 
334 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  56.59 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.15 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.86 
 
 
334 aa  350  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  55.89 
 
 
353 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.36 
 
 
334 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.42 
 
 
336 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  52.42 
 
 
336 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
333 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  52.42 
 
 
336 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  57.44 
 
 
334 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  55.02 
 
 
341 aa  346  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.68 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.82 
 
 
340 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.74 
 
 
338 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  53.78 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  53.17 
 
 
333 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 
332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.76 
 
 
326 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.36 
 
 
342 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.85 
 
 
338 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  55.25 
 
 
325 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.59 
 
 
334 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.98 
 
 
339 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 
339 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.41 
 
 
338 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  53.71 
 
 
338 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  51.2 
 
 
332 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.3 
 
 
332 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.29 
 
 
323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0064  alcohol dehydrogenase  52.99 
 
 
333 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  54.46 
 
 
322 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  54.28 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.28 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  54.28 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.69 
 
 
334 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.61 
 
 
332 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.41 
 
 
339 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.41 
 
 
339 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.41 
 
 
339 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.41 
 
 
339 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.41 
 
 
339 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  56.57 
 
 
328 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.69 
 
 
339 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.41 
 
 
360 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  52.15 
 
 
324 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  51.52 
 
 
328 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.41 
 
 
339 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 
344 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.24 
 
 
369 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.55 
 
 
356 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1295  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.12 
 
 
360 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0519873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.8 
 
 
339 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 
337 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  50.63 
 
 
345 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.63 
 
 
345 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
332 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0128  quinone oxidoreductase putative, PIG3  53.45 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  50 
 
 
328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.18 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0541  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0640  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.6 
 
 
332 aa  309  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3252  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>