More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0448 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  92.55 
 
 
255 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  77.47 
 
 
258 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  73.23 
 
 
259 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.02 
 
 
259 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.83 
 
 
259 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.52 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.94 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.98 
 
 
256 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  51.59 
 
 
255 aa  261  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
255 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  49.6 
 
 
255 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  49.41 
 
 
255 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.4 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.19 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
256 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
255 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.45 
 
 
256 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  46.46 
 
 
256 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.41 
 
 
256 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
256 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.24 
 
 
256 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  43.48 
 
 
257 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.48 
 
 
260 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.09 
 
 
256 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.88 
 
 
255 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  46.48 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.47 
 
 
257 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  42.75 
 
 
256 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  40.71 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 
248 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.5 
 
 
256 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.6 
 
 
272 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  40.5 
 
 
256 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  43.56 
 
 
227 aa  187  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  41 
 
 
259 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.61 
 
 
259 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.85 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  42.08 
 
 
255 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  39.85 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.06 
 
 
258 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
242 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.77 
 
 
258 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.48 
 
 
242 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.08 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  38.67 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  40.77 
 
 
284 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  40 
 
 
258 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.68 
 
 
257 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.68 
 
 
257 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.72 
 
 
252 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  37.35 
 
 
252 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.58 
 
 
271 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.94 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.46 
 
 
257 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.46 
 
 
257 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.04 
 
 
256 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.03 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.24 
 
 
269 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.7 
 
 
258 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.18 
 
 
279 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  36 
 
 
257 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.33 
 
 
263 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.49 
 
 
258 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.75 
 
 
267 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.18 
 
 
279 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.3 
 
 
250 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.51 
 
 
257 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.3 
 
 
250 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.25 
 
 
257 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.25 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.87 
 
 
255 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.02 
 
 
257 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.64 
 
 
245 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  34.66 
 
 
257 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.19 
 
 
257 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.3 
 
 
259 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.07 
 
 
240 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.33 
 
 
263 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.25 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.92 
 
 
256 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 
256 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.47 
 
 
264 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.65 
 
 
257 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.51 
 
 
259 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
257 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.66 
 
 
263 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.55 
 
 
273 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.55 
 
 
259 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.8 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.06 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.96 
 
 
266 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>