More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0408 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  100 
 
 		 389 aa  752    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  81.43 
 
 		 389 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  67.64 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  62.4 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  60.16 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  56.56 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  56.1 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  52.03 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  54.23 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  52.16 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  53.25 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  52.76 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  51.02 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  49.62 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  50.75 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  52.45 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  51.15 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  52.59 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  52.34 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  50.9 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  51.71 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  51.71 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  50.51 
 
 		 400 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  51.05 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  50.38 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  53.3 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  49.26 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  46.61 
 
 		 403 aa  342  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  50.13 
 
 		 405 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  48.6 
 
 		 392 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  51.04 
 
 		 392 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  50.65 
 
 		 400 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  47.57 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  54.16 
 
 		 1230 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  52.58 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  50.76 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  49.74 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  51.41 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  54.57 
 
 		 1230 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  50 
 
 		 400 aa  328  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  45.36 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  51.65 
 
 		 1305 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.5 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  47.33 
 
 		 391 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  48.35 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  47.98 
 
 		 393 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  47.98 
 
 		 393 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  50.51 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  51.78 
 
 		 1228 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  46.1 
 
 		 408 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  48.09 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  48.76 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  45.73 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  49.25 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  315  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  50.38 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  50.38 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  50.13 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  47.42 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  50.13 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  50.13 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  50.13 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.67 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  47.8 
 
 		 412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  47.51 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.28 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  49.12 
 
 		 399 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  46.68 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  47.14 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  51.01 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  49.01 
 
 		 413 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  51.01 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  46.23 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  42.38 
 
 		 399 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  48.45 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  44.1 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  46.55 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  45.2 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  49.09 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.45 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  45.94 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  40.51 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  45.05 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  44.1 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.45 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  39.9 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.65 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  42.07 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  39.53 
 
 		 408 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  43.91 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  50.83 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  42.32 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.25 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  39.8 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  40.7 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  38.56 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  39.55 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  38.4 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  40.59 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.44 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>