More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0232 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  86.38 
 
 		 389 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  100 
 
 		 373 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  66.94 
 
 		 377 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  66.41 
 
 		 384 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  68.08 
 
 		 382 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  68.08 
 
 		 382 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  54.46 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  51.03 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  48.22 
 
 		 420 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  51.25 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  50.31 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  49.69 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  50.47 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  49.69 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  48.44 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  49.86 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  51.51 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  49.07 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  47.71 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  46.98 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.55 
 
 		 340 aa  240  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  48.16 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  47.83 
 
 		 342 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  45.22 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  39.84 
 
 		 314 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  46.13 
 
 		 300 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  41.47 
 
 		 312 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  42.47 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  38.61 
 
 		 315 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.43 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  41.64 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  44.05 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  38.05 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  43.77 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  40.13 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  37.85 
 
 		 318 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  41.2 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 324 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  44.27 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  35.99 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  32.6 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 292 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.65 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  29.79 
 
 		 292 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  32.29 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.6 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  32.29 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  32.29 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  32.29 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 435 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  31.05 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.88 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  29.48 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  31.6 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  31.6 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  31.6 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  33.44 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  32.22 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  32.22 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.91 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  29.19 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  31.95 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.98 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  30.5 
 
 		 285 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  33.7 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 		 291 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  34.69 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.09 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  34.86 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  31.42 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.75 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  31.75 
 
 		 421 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  29.75 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  31.82 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  32.23 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  32.9 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  33.01 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  32.34 
 
 		 533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  28.18 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.16 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32.74 
 
 		 427 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  30 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 		 279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  30.7 
 
 		 279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  30.06 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 		 279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>