More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0168 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 		 333 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  86.79 
 
 		 333 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  78.01 
 
 		 338 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  77.11 
 
 		 357 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.6 
 
 		 357 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.6 
 
 		 347 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.96 
 
 		 343 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  74.05 
 
 		 324 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  71.56 
 
 		 327 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  73.65 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  70.15 
 
 		 327 aa  471  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.92 
 
 		 345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  71.7 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  72.31 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  73.02 
 
 		 323 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.98 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.52 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  72.38 
 
 		 323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  73.99 
 
 		 323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  73.65 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.33 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  62.94 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  65.71 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  62.03 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  64.42 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  62.94 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  60.76 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  61.34 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  60.7 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  59.81 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  59.49 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  54.11 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  51.9 
 
 		 351 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  51.95 
 
 		 343 aa  335  9e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  50.75 
 
 		 343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  47 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 305 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  47.96 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.26 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.67 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  43.2 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  45.61 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  48.3 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  45.24 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  45.58 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  45.24 
 
 		 304 aa  255  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  44.9 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  47.62 
 
 		 302 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.42 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.26 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.88 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.92 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.52 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.3 
 
 		 302 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  43 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  41.2 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.02 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.73 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2353  quinolinate synthetase  44.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.39 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  42.57 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  42.71 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  43.23 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  44.19 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  46.36 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.02 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  42.52 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  42.9 
 
 		 333 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  43.29 
 
 		 306 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  45.85 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  46.15 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  45.85 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  46.93 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0820  quinolinate synthetase  47.46 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  42.9 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  40.13 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.26 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.15 
 
 		 307 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.82 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  39.53 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  42.86 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  42.33 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.51 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  41.95 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  40.68 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  44.1 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  41.2 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  41.2 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  41.2 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.05 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.74 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  40.07 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.69 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.17 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  40.45 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  39.93 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.52 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  43.75 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  43.75 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>