20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0165 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0165  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00168593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4594  hypothetical protein  77.32 
 
 
98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1925  hypothetical protein  62.64 
 
 
121 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.116141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2600  hypothetical protein  65.56 
 
 
98 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0410  hypothetical protein  60 
 
 
98 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2246  hypothetical protein  63.74 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0399381  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1970  hypothetical protein  63.74 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0079  hypothetical protein  45.16 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2456  hypothetical protein  53.33 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1450  hypothetical protein  45.98 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2883  hypothetical protein  45.98 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3841  hypothetical protein  44.09 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4612  hypothetical protein  45.98 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1509  hypothetical protein  44.83 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0062  hypothetical protein  57.33 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1356  hypothetical protein  46.94 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2050  hypothetical protein  56.1 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0603  hypothetical protein  48.31 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1665  hypothetical protein  46.51 
 
 
102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3695  hypothetical protein  67.86 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>