More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0161 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 583 aa  1127    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  83.97 
 
 		 581 aa  925    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  57.34 
 
 		 598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  57.89 
 
 		 577 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  37.73 
 
 		 599 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  36.46 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  36.81 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.78 
 
 		 624 aa  257  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  32.02 
 
 		 621 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  31.9 
 
 		 583 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  31.84 
 
 		 1048 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 748 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  31.78 
 
 		 1275 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  27.41 
 
 		 1408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1065 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  30 
 
 		 1588 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  30.21 
 
 		 1085 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  38.85 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33 
 
 		 323 aa  130  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  32.37 
 
 		 1546 aa  130  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  35.19 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.14 
 
 		 276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  35.19 
 
 		 320 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.75 
 
 		 333 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  35.27 
 
 		 315 aa  126  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  32.75 
 
 		 320 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  35.27 
 
 		 315 aa  126  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  32.39 
 
 		 320 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  38.55 
 
 		 252 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.72 
 
 		 315 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.25 
 
 		 287 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  39.66 
 
 		 335 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  41.11 
 
 		 259 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  41.54 
 
 		 335 aa  122  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  44.13 
 
 		 300 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  26.35 
 
 		 263 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  35.11 
 
 		 760 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  34.67 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.71 
 
 		 256 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.46 
 
 		 740 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.43 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.43 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.23 
 
 		 253 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  38.78 
 
 		 327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  41.08 
 
 		 323 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.86 
 
 		 263 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.82 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  28.16 
 
 		 260 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30.04 
 
 		 273 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  26.37 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  26.74 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  26.37 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  26.74 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  26.74 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.03 
 
 		 324 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  26.37 
 
 		 263 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  42.22 
 
 		 323 aa  113  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  26.37 
 
 		 263 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  41.08 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  36.68 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.66 
 
 		 320 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  36.14 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  30.63 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  41.08 
 
 		 324 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.8 
 
 		 275 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  40.54 
 
 		 316 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  41.34 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  37.89 
 
 		 301 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  40.54 
 
 		 316 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.43 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  37.7 
 
 		 303 aa  109  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  32.86 
 
 		 738 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  31.23 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  43.02 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  29.89 
 
 		 250 aa  108  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.23 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  30.82 
 
 		 321 aa  108  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  40.78 
 
 		 347 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  37.85 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  37.85 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  39.2 
 
 		 345 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  35.47 
 
 		 341 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  31.76 
 
 		 354 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  39.01 
 
 		 301 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  39.01 
 
 		 301 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  39.01 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  39.01 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  39.01 
 
 		 301 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  36.23 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  39.01 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  42.04 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  39.01 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  33.81 
 
 		 280 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  39.01 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  39.01 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  37.85 
 
 		 346 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  34.83 
 
 		 349 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>