More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0117 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  73.92 
 
 		 453 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  875    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  59.21 
 
 		 493 aa  508  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  56.9 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  52.75 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 468 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  46.95 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 468 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 477 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 469 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 450 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.37 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  43.19 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.78 
 
 		 447 aa  296  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.32 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  40.05 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.46 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  40.05 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  40.05 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.57 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  39.34 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  39.43 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.61 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 460 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 456 aa  276  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  38.57 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  38.92 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  37.8 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  37.21 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  41.69 
 
 		 463 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.42 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.89 
 
 		 461 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.89 
 
 		 461 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.89 
 
 		 461 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  38.72 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.21 
 
 		 456 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 437 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.68 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 435 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 435 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  36.32 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  39.63 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 435 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  37.31 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  37.35 
 
 		 430 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 465 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  35.56 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.56 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  35.56 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  35.56 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  35.56 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.53 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  35.56 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  37.88 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>