162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0079 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  66.79 
 
 		 275 aa  331  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  66.79 
 
 		 286 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  80.37 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  66.17 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  66.67 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  56.48 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  54.76 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  54.76 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.47 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  48.04 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  38.13 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.19 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  41.52 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.29 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  44.29 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  42.65 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  35 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  34.74 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  36.45 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  32.7 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  35.29 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  36.02 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  39.22 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  31.79 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  33.14 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  33.92 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  33.92 
 
 		 327 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  33.53 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  34.1 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  32.11 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  32.5 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  29.85 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.27 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  33.64 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  32.28 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  36.14 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  28.17 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  30.61 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  31.22 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.29 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.79 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.52 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  26.87 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  22.71 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  30.69 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  28.96 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  25.27 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  28.16 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  27.88 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  29.91 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  30.1 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.14 
 
 		 204 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  29.78 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  22.61 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  26.53 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  24.48 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  28.93 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  33.15 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  31.4 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  29.78 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  31.18 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25.98 
 
 		 194 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  31.47 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.98 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  31.79 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  26.2 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  25.79 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  24.68 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  28.31 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  38.04 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.78 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  31.68 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  28.49 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.88 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  35.51 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  31.63 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  22.95 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  25.76 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  26.01 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.57 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  27.78 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  29.03 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  26.98 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  29.47 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  29.7 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  23.5 
 
 		 200 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.8 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  37.39 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.8 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  29.38 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  25.79 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  25.9 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  28.42 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  30.77 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  32.43 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>