More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0078 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 471 aa  951    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  56.24 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  56.6 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  53.32 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  52.12 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  43.87 
 
 		 357 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  41.36 
 
 		 633 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.68 
 
 		 354 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  39.27 
 
 		 612 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 		 680 aa  89.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  34.66 
 
 		 1392 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  35.46 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  40.6 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  34.72 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.33 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  35.61 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  37.88 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  37.88 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.84 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.28 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 1105 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  34.03 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  33.77 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  37.32 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.22 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  38.64 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.04 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.23 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.61 
 
 		 1141 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  30 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.66 
 
 		 1089 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 1160 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 		 1094 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.62 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 1142 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  36.76 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0776  hypothetical protein  30.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 		 1172 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 		 607 aa  67  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  31 
 
 		 275 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 1139 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  33.54 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 271 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 		 1198 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 271 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.81 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  26.49 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  37.1 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 1151 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 1148 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 1151 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.21 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 		 1209 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 1027 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 1027 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  34.32 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 1027 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  37.89 
 
 		 667 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  38.38 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.83 
 
 		 1180 aa  63.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.25 
 
 		 577 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 		 859 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.95 
 
 		 648 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  37.37 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 597 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.13 
 
 		 1149 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 		 1156 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.06 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.53 
 
 		 643 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.04 
 
 		 1087 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.34 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>