21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0075 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  100 
 
 		 381 aa  771    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  74.8 
 
 		 381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  60.61 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  53.72 
 
 		 371 aa  362  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  52.04 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  49 
 
 		 365 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  47.54 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  48.41 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  46.74 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  45.92 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  49.27 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  49.27 
 
 		 365 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  46.63 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  47.13 
 
 		 368 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  43.62 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  42.55 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  44.33 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  40.63 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  38.76 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03885  hypothetical protein  37.31 
 
 		 117 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0037  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.83 
 
 		 533 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.994153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>